Tuesday, October 16, 2012

シーケンスデータの予備解析を始めてみた。本当はノイズやエラーを綺麗にしてから解析しなければいけないのだけれど、それはやるとすごい時間がかかるらしいから、とりあえず予備解析。各遺伝子座ごとに、フォワードとリバースの配列を合わせて、一致しているサイトを見るだけ。ノイズが沢山有るかと思いきや、けっこう綺麗に読めてた。ところどころノイズがあるので、それは後でスクリーニングしないといけないし、綺麗に見えるところもそれはエラーで本当は変異があるかもしれないので、結局は全部チェックしないといけないのだろう。熟練者でも1ヶ月以上かかるらしく、素人がやると、2,3ヶ月かかるのかもしれない。今のところパタンは言われていた通り、とても保守的だでした。もう少し解析を進めてみて、その後はマイクロサテライトを考えたほうが良いのかもしれない。

夜は遠洋水産から日本人研究者の人が来て、永康街で小籠包を食べて、マンゴーカキ氷を食べて、師範夜市で大きな鶏唐食べて、帰りに西瓜ミルクを飲んで。トレーニングしないと。


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